一百年前，由于火山爆发而出的尘灰笼罩了整个地球上空，自此这个世界便失去了阳光，植物几近灭绝，人类面临着缺氧的严峻形势。为了解决这一困境、延续人类的生命，科学家麦克·阿德尔研究将特殊处理过的“种子”埋入将死之人的腹部中，使“种子”在那人的肉体上生根发芽，并且经过两年的成长之后就会变成各种各样的植物。这就是“发芽”技术的由来。而实施“发芽”手术的地方，就是叶嘉琪所在萌芽所。
叶嘉琪，2310年5月5日生，北洛市东区罗克镇人，萌芽所办公处职员。
2034年12月9日，清晨的阳光透过窗户洒进了卧室，叶嘉琪慢慢地睁开双眼，伸了一个懒腰。她迅速地起床，洗漱之后，穿上一身得体的制服，早早地来到萌芽所。她的眼睛清澈明亮，总是带着微笑，给人一种邻家女孩的感觉。
今天刚好是叶嘉琪来到萌芽所办公处工作的一周年。一到办公室，她就打开电脑，开始处理各种文件和邮件。虽然偶尔也会摸鱼追追综艺什么的，但她总是能够及时完成手头的工作，做事干练利落。
在办公室里，叶嘉琪总是一副温和的模样，但她的同事们都知道，她是个非常有主见的人，能够坚定地表达自己的看法，在关键时刻挺身而出，给团队带来许多惊喜。
上午11点，叶嘉琪接到一个电话，说是诊疗室发生了一点问题，需要她过去帮忙。于是，嘉琪赶紧换上防护服，径直走向了诊疗室。
到了诊疗室之后，她注意到其中一个已经接受了“发芽”手术的人似乎有些异常：被埋入腹部的种子迅速发芽成长，分裂成数株藤蔓枝条，并将他包裹了起来，完全变成了“绿宝石”。叶嘉琪吓了一大跳，她从未见过这样的情况。她马上跟助手陈芸要来资料，发现他做完手术还不到一个小时。据病历来看，这个人是胃癌晚期，名字叫做李明。
同事们议论纷纷，有人认为这是新的变异品种，也有人担心这是某种未知的疾病。叶嘉琪决定向副所长金晶报告此事。当天下午，她拿着报告走进了副所长办公室。副所长金晶看到报告后，脸色变得凝重起来。他告诉叶嘉琪，这种情况以前从未发生过，可能是“发芽”技术出现了问题。
为了弄清楚原因，金晶决定组织成立一个专项调查工作组，由自己任组长，成员为叶嘉琪、陈芸、何泽等三名办公处职员。
中午过后，嘉琪他们迅速将李明转移到了实验室里，进行了一系列的检测和分析。然而，结果却令所有人震惊——李明虽然完全变成了藤蔓植物，身上看不出一点人类的特征，但依旧显示出高度的智能，并且能够与人交流，表达自己的想法和感受。不知为何，手术过程中出现了异变，导致他变成了现在这样奇特的模样。他痛苦地在实验台上挣扎着，大声呼喊“放我回家”。
叶嘉琪和副所长金晶意识到，这一发现可能会对“发芽”技术产生重大影响，甚至改变人类的未来。
他们无视了李明的需求，而是把他继续留在萌芽所的秘密实验室里，决定深入研究，寻找解决问题的方法。他们将李明这一特殊的“绿宝石”起名为：祖母绿。
在紧张的氛围中，叶嘉琪他们更加努力地投入研究。他们希望能够找到祖母绿的形成原因，同时也探索“发芽”技术的潜在风险和改进方向。
与此同时，祖母绿也在逐渐适应自己的新身体。他慢慢发现自己能够控制藤蔓进行缠绕，并利用延伸的枝条寻找东西。下午4点45分，由于长时间被囚禁在实验台上，一口水也没喝，他实在受不了。喝水的欲望越来越强烈，他从藤蔓末端伸出了一小段枝条，寻找到了矿泉水并刺破瓶子，用尖端吸取水分。不过他并没有马上如实告知嘉琪他们，而是继续假装配合研究。他打算利用自己的智慧和这个特殊能力，等待一个逃离出去实验室的机会。
晚上8点，叶嘉琪收到一封匿名信，警告她必须停止研究，否则后果自负。她感到一阵寒意袭来，但并没有被吓倒。相反，她更加坚定了要解开这个谜团的决心。叶嘉琪将匿名信交给了副所长金晶，金晶交代嘉琪他们要加快研究进度。很快，嘉琪他们发现，李明的身体结构与普通的“绿宝石”有很大差异，似乎蕴含着某种强大的能量。
就在他们准备进一步研究时，萌芽所实验室突然遭到了一群身份不明的人袭击。
萌芽所办公楼右侧起火了，外面聚集着一群公安警察，并把附近路段给封锁了。不久来了两辆消防车，消防人员正在有序灭火，困在楼里的人们都被疏散到了安全地带。后来，人们对于这个事件有诸多疑问，但萌芽所对外只是宣称办公楼因不明原因起火了，受困人员均已经被民警和消防人员救出，无人伤亡，起火原因有待后续调查。
晚上11点，嘉琪和陈芸在病床上醒来。副所长金晶和同事何泽过来探望，并透露一个震惊的事实：祖母绿消失不见了。嘉琪他们意识到，这不仅仅是科学研究的问题，背后可能隐藏着巨大的阴谋。
嘉琪回忆起被神秘人袭击的那时候……
她记得，当时数名黑衣男子悄无声息地出现在他们身后，把他们迅速控制了下来，其中一个把枪抵在她的背部。
你们不该继续下去。
你是谁？为什么要攻击我们？
我们是谁并不重要。重要的是，你们妨碍了我们的计划。
你们到底有什么目的？“发芽”技术是为了拯救人类？你们究竟想干嘛？
拯救人类？真是可笑。你们以为“发芽”技术真的能拯救这个世界吗？
它不过是一个导火索，之后会引发更大的灾难。
叶嘉琪和陈芸对视了一眼，心中充满了疑惑。难道“发芽”技术还有什么不为人知的秘密？为了继续引出更多有用的信息，她们放弃挣扎，假装配合神秘男子。
真相总会大白的，但不是现在。你们还是先考虑一下自己的安危吧。
说完，男子按下手中的遥控器，实验室传来巨大的爆炸声，接着就开始起火，楼层四周顿时响起警报声。接着，神秘黑衣男子把嘉琪和陈芸都打晕了。
嘉琪的记忆就到这里中断了。
在接下来的一个月，嘉琪他们发现了一些关于神秘组织的重要线索，这也让他们更加坚信，一定要揭开“发芽”技术背后的真相。
我们不能让那些神秘组织得逞。必须尽快找出真相。
可是我们现在对他们的了解太少了，得想办法获取更多情报。
我们必须阻止他们！
接下来的日子里，叶嘉琪和同事们日夜不停地工作，试图找出解决问题的方法。而那株祖母绿，则成为了他们关注的焦点，目前在内部也仅有副所长和他们三人知道。