李时珍的父亲李言闻，出生在湖广省黄州府蕲州县的一个普通人家。他从小就立志考取功名，因此他学习十分刻苦，加上他天资聪颖，李言闻很快就考取了秀才。
考上秀才，接着准备考取举人。但后来，老天似乎给李言闻开了一个玩笑，考了几次乡试，一直没有中举。于是李言闻就选择放弃了科举之路，在家乡蕲州县开办了一个的医馆，专心做一个救死扶伤的大夫。
在家乡蕲州县，李言闻因为考取过秀才，有些名气，加上他医术高明、医德高尚，渐渐地找他看病的人越来越多，而他也因此成了蕲州县的名医。
在李言闻的医馆里，前来看病的病人几乎都是穷苦百姓，有的病人甚至都付不起诊金。但李言闻心地善良，非常同情这些穷苦的病人，不但不收诊金，还会赠予治病相关的草药。
李言闻仅靠在医馆里给乡亲们治病带来的微薄收入，并不能维持生活，有时他还会去蕲州附近的网湖打鱼。
哪怕日子过得辛苦，李言闻和夫人张氏也没抱怨，夫妻俩不求大富大贵，只想早点有个孩子。而这一天，很快就到来了。
正德十三年（1518年），李时珍出生。
在李时珍出生当天，父亲李言闻并不知情，李言闻像往常一样守在医馆里，看到当天风和日丽，医馆也没什么生意，于是早早把医馆关门了。
将医馆关门之后，李言闻想着到蕲州附近的雨湖去打几条鱼回来，改善一下伙食。于是一手拿着鱼篓，一手拿着渔网，一路小跑着，很快就来到了雨湖。
网湖是蕲州最大的湖，面积比较大，鱼类众多，水产品也比较丰富，因此网湖养活了很多附近的渔民。
李言闻在网湖边上找了一个很好的位置，连续下了几次网，竟然一条鱼没捞着，不禁有些灰心。临走前，决定再下一网，这一网下去，费了好大力气才拉起来，还以为捞起来的是几条大鱼，没想到竟是一块石头。
李言闻有些失望地说：“石头呀石头，我与你无冤无仇，今天为何要捉弄于我？让我今天空手而回。”
李言闻回家后，妻子张氏很开心的告诉他生下了一个儿子。说完，便把手里抱着的儿子送到丈夫李言闻跟前。
李言闻看到眼前白白胖胖的儿子，很是高兴。但思绪一下联想到今天打鱼捞出石头的事情，所以想也没想，就脱口而出：“夫人，我看，我们的儿子，就叫他石珍吧。”
妻子张氏一听，不禁有些疑惑的说道：“石珍？这名字不太好听，像个女孩子名字，我看还是叫他时珍吧！”
李时珍的名字，就这么定了下来。
李时珍从小就聪明过人，勤奋好学。李言闻看到儿子这么用心读书，心里非常高兴。时常督促他学习，将来能够考取功名，光耀门楣。
嘉靖七年（1528年）六月，此时正值夏季，荆王妃病重，荆王府派人来请李言闻前去诊治，李闻言急忙去了荆王府。由于李闻言医术高明，当天就治好了荆王妃。荆王一高兴，就赏赐很多珠宝给李言闻，但都被李言闻谢绝了，并表示大夫治病救人，是分内之事。
由此可见，李言闻是个道德高尚的人，这对李时珍以后的为人处世产生了极大地影响。
嘉靖十三年（1531年），李时珍到湖广省黄州府参加科举考试，一举考中秀才。这个消息，让一路陪伴同行的父亲李言闻十分激动。李时珍考中秀才的消息，一下就传开了。这一年，李时珍14岁。他也因此，被称为“神童”。
蕲州名门顾家得知消息后，特意派人邀请李言闻父子去顾家做客。顾家在蕲州是大家族，家族中有几人在朝廷中任职，因此顾家在蕲州相当有实力、相当有名望。
李时珍父子受到顾家的邀请，便很快来到了顾家。
顾家管家在大门迎接李言闻父子进入厢房等待，不一会儿，顾家族长顾敦来到厢房接见李言闻父子二人。
顾敦对李言闻说：“李秀才，你真是教子有方呀，时珍这孩子，小小年纪就考中了秀才，我看他将来，一定前途无量。李秀才，我看你是有福气之人呀。”
李言闻听后，连忙回答道：“顾老爷太过奖了，小儿时珍这是托顾老爷的福，侥幸中了秀才，今后还望顾老爷多多教诲。”
顾敦看向一旁的少年李时珍，对李闻言说道：“李秀才，你不必过谦了，我十分看好这孩子，顾家别的不多，顾家就藏书很多，你可让时珍这孩子，随时过来看书，多学习学习，为以后考取举人做准备。”
此事过后，李时珍时刻来顾家查阅合种典籍，一边学习、一边成长，为之后的乡试做准备。
湖广省的乡试设在武昌府举行。
李时珍先后参加两次乡试，均未中举。经历过两次乡试失败之后，李时珍已经对乡试不抱希望了，心里反而更想做个大夫，像父亲一样受人欢迎的大夫。但父亲李言闻并未放弃李时珍的科考之路，反而一直坚信儿子会出人头地、考上举人。
嘉靖十九年（1540年），在父亲李言闻的鼓励和陪同下，李时珍抱着极大的希望，来到武昌府参加第三次乡试。很可惜，依旧没考上举人，先后三次乡试不中，让李时珍决定向父亲学习医术。这一年，李时珍22岁。
嘉靖二十四年（1545年），蕲州发生了一次重大水灾，灾后又发生了瘟疫，因此，许多人相继死亡。此刻，大夫成了穷苦百姓的“救星”。父亲李言闻和母亲张氏商量之后，决心全力救治蕲州城内感染瘟疫的百姓。
于是李时珍父子在家中临时设立一个简单的医馆，全力地为百姓治病防疫，经过李时珍父子的精心救治，救活了很多百姓的性命，此事让李时珍父子深受蕲州城百姓的爱戴。
在救治感染瘟疫的百姓时，李时珍接触到了许多疑难病症。开始无从下手，后来翻阅医书典籍寻找类似病因，再后来同父亲一起研究病情、对症下药，最后药到病除。
经过治疗瘟疫病人之后，让李时珍对医术产生更加浓厚的兴趣，并立志要做一个“悬壶济世”的医生。这一年，李时珍27岁。